Le chiffrement se base donc sur la langue Navajo. Ce code peut être séparé en 2 parties. Certains mots, importants pour l’affaire militaire seront traduit directement de l’anglais au navajo. Ces mots sont consignés dans un petit dictionnaire de chiffrement. Certains termes modernes qui n’existent pas en Navajo ont été remplacés par des métaphores ou ressemblances. Ainsi le mot anglais “avion” sera chiffré par la traduction “oiseau” en Navajo.

Le code se base donc sur une traduction de certains mots mais aussi par une épellation des autres mots. Pour cette partie, chaque lettre anglaise se voit attribuée de 1 à 4 mots anglais commençant par la même lettre. Le code talker Navajo pourra donc utiliser quatre mots différents dans sa langue natale afin de faire passer une lettre de la langue anglaise. Le fait d’avoir plusieurs mots pour la même lettre est très intéressant, surtout dans le cas où la même lettre apparait plusieurs fois dans le même mot ou message, cela permettra de le chiffrer de deux manières différentes.